反三角貿易申報營業稅 - 會計

小弟我剛到一外商就職，發現內部報營業稅的作法有點奇葩，跟以往所知不太一樣
，想請問一下板上各位高手。

行業特性：
為外國企業在台子公司，接國內客戶訂單轉到海外母公司工廠，再由客戶自行報關進口。
會加成工廠的invoice價格，差價作為佣金收入。
最後以海外工廠為買受人開二聯應稅發票。

問題一：公司開發票的時點不是在認列銷貨收入的時候，而是在實際收款的時候。
就我所知，買賣業應該在出貨或收款哪個早的時點開立發票，如果沖應收才開發票會不會
有晚開的問題？
還是我們算行紀，ok?

問題二：因為是認價差作佣金收入，有時會因業務談判，導致有些品項或invoice出現零
毛利或負毛利，這時會把他踢掉。
請問營業稅有規定要排除這種狀況嗎？

請不吝賜教，如果可以，希望可附法條或解釋。

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