服務業勞工上班車禍，職災 - 醫生

我是做餐廳服務業的
在上班途中出車禍，被撞飛
送去醫院急診時公司拿了一萬元給同事
請同事陪我去醫院
第一個急診醫院只有幾查出脊椎一節碎裂，
所以沒住院第一天就出院，
之後半個月我還是無法走路，
再去第二間醫院檢查才發現多處骨折，
但因已經可以慢慢扶著東西走路也不需住院就回家了。
因脊椎部分較難復原，醫師建議修養三個月。
(上班需站立，醫生不建議上班)
公司也接受了我的講法，當然我也有開醫生證明，就診收據全都有。
之後，三個月稍微復原了(未完全痊癒)我也就馬上回去上班。
休養的三個月他完全無給付我薪資，也無任何所謂的慰問金。
回公司沒幾天後他就跟我索取當初急診時的一萬元，
說這三個月公司都有幫我出勞健保
(不是本來就應該付嘛？我是職災他也不能斷保阿！)，所以一萬元要還公司。
我真的越想越不對.....請問我該怎麼處理？
走法律途徑？需要哪些資料？他拿一萬給我我也沒簽名阿？
他還說一萬要從薪資裡扣....
ps:本是想說不想計較那麼多，當初他都幫我出了一萬元。
但現在要跟我要回這一萬元真的感覺很差。