發票數量與出貨單數量不符 - 會計

公司已收客戶10%訂金 已開發票。出貨是分批出貨，隨貨附發票。
假設單價10，總量1000pcs，分兩次出貨，600pcs跟400pcs
客戶希望發票這樣開：依當次出貨額的九成金額 (並註明總額扣除訂金一成)
第一次的發票：600pcs*10-600(訂金)=5400 第二次：400pcs*10-400(訂金)=3600

但會計開的發票是 500pcs*10=5000(訂金1000=100pcs*10，此次直接扣除)
下次的發票就是：400pcs*10=4000

結果客戶收到發票打來說沒有人這樣開的，跟出貨單不符，希望我們重開，但會計很堅持
，並說總金額正確就好了。因為不是學這方面的又是新鮮人(我是覺得客戶的比較合理)
，想請問大家一般公司做法是怎樣，哪個才是正確的? 謝謝大家了~

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