職業傷害期間及之後薪水被扣，且老闆未告知 - 工作

我在2012年11月14日下班途中發生車禍
從11/15開始請假，到2013年1月2日才回到公司上班。
1/2回去上班當天，便被副總叫去私下談話。
副總表示老闆想要將我的薪水調降4000，原因是我現在做的不是研發，而是行政文書類的工作，又說工程師的薪水是包含加班費(我們公司沒有加班費這回事)，現在不用加班所以要扣薪，問我有什麼意見。
我的職稱是工程師，現在之所以會處理公司的行政事務是因為秘書突然離職，因此緊急被調派過來幫忙，且當初老闆的說詞是：暫時幫忙、等它徵到秘書後再把事務交接給新秘書。但之後一直沒徵到秘書，公司又沒有接到案子，所以我到現在還在做行政的工作。
簡單來說就是公司先擅自更改了我的工作內容，接著再依照我的工作內容要求減薪。
因此我向副總表示我覺得不能接受，副總說「他會向老闆反應」，之後便無下文。
今天和會計閒聊時才得知，我的薪水已經偷偷被改成-4000之後的薪水，直稱好像也被改掉了。重點是，我回去上班後公司才在1/7支付給我從「2012年11月15開始到12月間」的薪水也全部都是用減薪後的薪水下去算，而且上面所說的變動都完全沒有告知我。
因為我們公司「沒有薪資條」所以到今天才發現。
想請問我們公司是否違法？
公司可以擅自減少我請假期間的薪水嗎？
可以在未告知的狀況下調整職稱和薪水嗎？
感謝。